Next of Kin son premier long métrage est réalisé en 1984. Le budget réduit de ce film, 37 000$ est en partie financé par la vente de Open House à Canadian Broadcast Corporation. Présenté dans la catégorie controversée "Perspective Canada" du Festival du Film de Toronto la même année, le film révèle le réalisateur comme un des grands espoirs du cinéma canadien. Après ce début de succès, Egoyan réalise plusieurs téléfilms et des épisodes de séries aussi prestigieuses que La Nouvelle Quatrième Dimension, Vendredi 13, ou encore Alfred Hitchcock Présente.

Cette activité ne l'empêche pas pour autant de songer à son deuxième film de cinéma. Il réalise ainsi en 1987 Family Viewing qui marque un tournant dans sa carrière. La même année Wim Wenders invité au festival du Nouveau Cinéma et Vidéo de Montréal, reçoit un prix de 5000$ pour Les Ailes du désir, prix qu'il donne à Egoyan : "c'est un grand honneur, mais je vous demande de mettre le nom de mon collègue canadien Atom Egoyan sur le prix " déclara sobrement le réalisateur allemand.

Quatre ans plus tard sa notoriété est internationale. Il a enchaîné diverses expériences artistiques dans une volonté toujours plus grande d'approfondir sa recherche cinématographique. En 1991 il réalise son quatrième long métrage, The Adjuster, qui reçoit un prix de 25 000$ au Festival des Festival qu'il donne … à un jeune réalisateur inconnu John Pozer qui vient de réaliser son premier long métrage The Grocer's Wife (la Femme de l'Epicier).

En 1992, ce plus jeune canadien jamais nominé comme meilleur réalisateur, participe à Montréal vu par… Six Variations sur un Thème en réalisant Episode 4 : en passant.

1993, l'année de la maturité, Egoyan sort deux films importants : Calendar, qui lui permet d'effectuer un retour à la vidéo, tandis qu'Exotica sera primé par le prix International de la critique au festival de Cannes.

Papa depuis quelques années d'un fils que lui a donné sa femme Arsinée Khanjian, arméno-canadienne comme lui, il signe en 1995 un court-métrage pour la BBC Portrait of Arshile. Quel rapport me direz-vous ? La règle de cette commande était de créer des images personnelles formant un film de 4 minutes à propos d'un peintre. Atom Egoyan voit ici l'occasion de faire un hommage testament à son fils qu'il baptisa du nom d'un peintre arménien Arshile Gorky.

Retrouvant ses premières ambitions de théâtre vivant, ce guitariste classique amateur se tourne vers l'opéra. En 1996, à l'opéra de Toronto, il met en scène Salomé de Richard Strauss. Il intègre au jeu scénique des images vidéos projetées. Sa mise en scène saluée autant par la critique que par le public encourage Egoyan.
Il réécrit également une pièce inventée alors qu'il était lycéen : Elsewhereless. Mis en musique par Rodney Sharman, c'est un projet qui mit de longues années pour aboutir enfin à Toronto au Tapestry Music Theater en avril 1998.
Entre ces deux expériences il réalise en 1997 un moyen métrage Bach Cello Suite #4 : Sarabande sur le travail d'un violoncelliste Yoyo Ma.

C'est avec De Beaux Lendemains (Grand Prix du Jury à Cannes) réalisé la même année qu'Egoyan accède à la consécration, tandis qu'il poursuit son expérience scénique avec l'opéra Doctor Ox's Experiment, adaptation de Jules Vernes sur une musique de Gavin Bryars, jouée pour le première fois à londres en juin 1998.

Anne-Laure Bell